Ja, der kan være bivirkninger, især hvis olien bruges ufortyndet eller i store mængder. Disse kan vise sig som hudirritation, allergiske reaktioner eller maveproblemer. Hvis du indtager oreganoolie gennem munden, er det vigtigt altid at fortynde oreganoolie og teste en lille mængde først. Hvis du benytter oreganoolien til at børste på tænder og gummer kan misfarvning forekomme.
Oreganoolie kan også interagere med visse medikamenter, såsom blodfortyndende midler, diabetesmedicin og blodtryksmedicin. Det er vigtigt at konsultere en læge, før du bruger oreganoolie, hvis du tager nogen form for medicin. Hvis du kun børster tænder og gummer med olien med henblik på at hæmme de bakterier, som ligger til grund for udviklingen af paradentose og således ikke sluger oreganoolien, så er der ingen kendte bivirkninger, bortset fra risiko for misfarvning. Det tilrådes dog at få en tandlæge til at kontrollere, om olien rent faktisk har en effekt på din paradentose, da dette ikke er videnskabeligt dokumenteret.